他奄奄一息地被渔船从海上捞起，他改换容貌身藏胶片，他枪法如神会说多国语言，他拥有百万现金瑞士银行账号，他隐藏着N国护照......。他到底是谁？代号杰森·伯恩？CIA特工大卫·韦伯？又或者是一个没有过去，或许也不会有未来的男人？曾经，他可以不在意那一系列令人发狂的谜团，抛开埋藏在大脑深处的记忆，罔顾防不胜防的杀手偷袭，一心只想消失于人海，化名隐身在偏僻的海滨小镇，和心爱的女人过着平静的日子。
然而，平凡的生活注定与他无缘，失去了记忆，亲眼目睹女友玛丽中枪身亡，更有神秘杀手接踵而来，悲愤的杰森·伯恩（马特·达蒙）决定以其人之道还治其人之身--主动出击，四处寻觅中情局特工行踪，报仇之余更为自己的身份寻找证据。而在之前一直担任中情局联络人的女特工妮基（朱丽娅·斯蒂尔斯）再一次成为伯恩得力的帮手。
显然，不用伯恩找上门去，神出鬼没的杀手们已如影而至。警方、联邦政府、国际刑事组织，甚至还有那些隐藏深处的秘密组织，每一方都盯上了这个危险得如同一颗定时炸弹的男人。不过，就算是如雨的索命枪弹、训练有素的杀手、惊天的阴谋也不能阻挡伯恩的去路，很快，凭着杀手的本能，伯恩从一位名叫山姆·罗斯的记者处，打探到了更多中情局的老底。一切都将如拼图般恢复原状，伯恩的足迹踏遍全球，只为了一个目的：回到最初，找出自己的真实身份！
《谍影重重3：最后通牒》是《谍影重重》系列的最后一集，首两集《谍影重重》（The Bourne Identity）及《谍影重重2：机密圈套》（The Bourne Supremacy）紧张刺激，动作设计崭新又剧力万钧，于全球取得骄人的票房成绩：第一集全球票房收超过2亿美金，后者更接近3亿，可谓叫好又叫座。最后一集继续由廿八岁便成为奥斯卡影帝的马特•达蒙饰演职业杀手伯恩（Jason Bourne），并于摩洛哥、西班牙、法国、英国和美国等多个地点取景，动作、特技、剧本都比第一、二集更上一层楼。

本集讲述伯恩只想静悄悄地消失在人群中，但却不断遭受训练他成为职业杀手的政府单位追杀，他不但失去记忆，更失去唯一心爱的人，悲愤莫名迫使他无惧最先进武器及四方八面的狙击手，勇往直前从莫斯科开始这趟冒险旅程，向巴黎、伦敦及丹吉尔(Tangier)进发，最后回到纽约市，千方百计解开自己的身份之谜，揪出被穷追猛杀的因由及幕后黑手！

如果说伊恩·弗莱明的007是个优雅浮华的代号，那么罗伯特·勒德姆创作的杰森·伯恩的真实低调恰恰是007的反面。他不会身着燕尾服、喝着马蒂尼、开着阿斯顿·马丁跑车、换女人如换衣服，不会逢人就骄傲地自报家门，更是个世间少有的痴情种子，可比起那个大英帝国的特工，这个忘记自己身份的男人却以坚韧刚毅的性格、粗犷帅气的外形、无所畏惧的态度、矫健实战的身手、无人能敌的机智赢得了间谍影片至尊，而《谍影重重》电影的诞生才不过几年而已。也难怪，连纵横江湖40多年的老前辈邦德去年再现江湖，也不免跟伯恩学习学习，改换模样多了些许人性化和真实。（说来古怪，杰森·伯恩和詹姆斯·邦德都缩写为J.B.，巧合乎？）
杰森·伯恩到底是谁？这个贯穿于系列电影的谜题，将再一次成为影片张力十足的焦点。为了寻求最终的答案，身手矫健的马特·达蒙又一次穿行于莫斯科、巴黎、马德里、伦敦和纽约城际。虽然改编自“谍影重重”系列的小说的终结篇《伯恩的最后通牒》，但失去记忆的伯恩能否找到自己的真实身份，还是个未知的谜题。
去年凭《93号航班》得到奥斯卡青睐的导演保罗·格林格拉斯，在席卷全球5亿票房的谍影诱惑下如约归来，其擅长的如坐针毡的对峙氛围和让人啧啧称赞的写实手法，想必轻而易举就能将紧凑的叙事激发得更加紧张刺激。而新一代特工的代言人马特·达蒙也不出意外，重拾了伯恩险阻重重的身份探秘之路。

有血有肉的间谍故事
来到叛谍系列的最后一集, 导演希望可以用一个不同的角度拍摄, 他说：「《谍影重重3:最后通谍》是一部与众不同的间谍片, 她比一般间谍片更人性化, 更有说服力, 我希望观众坐在戏院时就像看到新闻直播一样, 亲身感受追逐和爆破场面, 犹如置身现场一样。」
小说与电影
伯恩这个由美国著名作家罗伯特•勒德姆(Robert Ludlum)创造的国际特务英雄，于1980年出版的《The Bourne Identity》初次登场，即以神秘形象和惊险的间谍活动疯魔万千读者，2002年被首度搬上银幕，由马特•达蒙演绎这英雄人物。罗伯特•勒德姆继而在1986年出版了同系列的第二部作品《The Bourne Supremacy》，当年此书连续25星期登上【纽约时报】的最畅销书榜，其中8星期更高踞第一位。1990年，罗伯特完成《The Bourne Ultimatum》，凑成了伯恩三部曲著作。本片就是改编自最后一部作品《The Bourne Ultimatum》。外间一直认为作者罗伯特与中情局人员有密切关系, 所以小说内容可信程度极高, 更有人认为罗伯特的小说揭开了许多中情局鲜为人知的秘密。

花絮：
伯恩的最后通牒？“伯恩之父”罗伯特·勒德姆多年前替自己的谍报经典《谍影重重》系列第三本取名时，早已定下了系列终极之作的基调。可对于野心勃勃想把伯恩系列变成新一代007金字招牌的环球公司，区区三部卖座电影显然太少，于是为了更有时代特性，也为了不拘泥于小说原著，也许更为了替下一部续集延续素材，虽然挂上了伯恩终极之作的招牌，影片中的情节却与小说原著几乎风马牛不相及。眼见着“伯恩之父”早在第一部电影拍竣之前就已仙去，这之后必须从头“瞎编”的第四部、第五部、第六部甚至更多难免不让人打上几个大问号。
事实上，伯恩的完美化身马特·达蒙便是对此最有疑问的一位--在早前戛纳宣传《十三罗汉》时，达蒙便坦承《谍影重重3》很可能是他最后一次饰演气魄逼人的伯恩一角。虽然这位《谍影重重》系列电影的大功臣还没有做出铁定离开的决定，但如果失去他这个致命武器，系列前景总少不了些许磕磕碰碰。就像以后的詹姆斯·邦德很难再超越肖恩·康纳利，如果环球计划学步007系列，让《谍影重重》成为演员不断更新换代的长寿特工电影，他们的任务还很艰巨。
马特;达蒙突破固有形象 演活冷酷间谍
导演保罗;格林格拉斯为增加电影的独特性，找来从没被邀请饰演这类角色的马特•达蒙为男主角，马特;达蒙是保罗心目中的第一人选，他也乐于接受挑战。马特;达蒙回想：「若开拍《谍影重重》这类动作电影，没有人会想起我，可能我看起来太年轻，不太像是个冷酷杀手。很开心保罗竟然来找我，让我突破以往形象扮演伯恩这个角色，这其实是一个拍出有别于其它动作片的好机会。」
为了把角色演好，马特;达蒙接受了严格的体能训练，他花了三个月时间接受武术、拳击和武器训练，锻练出一身好体格，也学了一种叫卡力的菲律宾搏击术。这种速度很快，通常只有三、四个动作就能阻挡、引诱和摧毁敌人的搏击术，让马特;达蒙在演出打斗场面时显得更加准确有力。结果证明保罗的确独具慧眼，不但在银幕上成功塑造了一个全新的动作片英雄，也让马特;达蒙的演艺事业有了突破性的发展。
终极复仇 走遍世界各地
为了增强观众的感官刺激, 本片动用超过250人在纽约市﹑丹吉尔(Tangier)﹑伦敦﹑巴黎﹑马德里﹑柏林等地拍摄。